El primer hospital que existió en la ciudad de Durango, fue fundado el día 31 de julio de 1595 por petición de Diego de Villar, Procurador de la Villa de Durango. Se puso bajo la advocación de la Santa Veracruz y su primer Administración fue Alonso Meléndez. Tiempo después, se encargaron de su administración los religiosos de San Juan de Dios y el Hospital cambio de nombre para llamarse de San Cosme y San Damián. Los primeros religiosos Juaninos que lo atendieron Fray Francisco Ferrer y Fray Juan de Torres.

Por más de un siglo, vivió el hospital de limosnas y en absoluta miseria, hasta el año de 1726 en que el Gobernador don Manuel de San Juan y Santa Cruz, se solicitó al rey de España ayuda para mejorar la institución. Por real orden del 25 de Abril de 1719 se reparó el edificio del hospital, se aumentó a seis el número de religiosos que lo atendían, además de un capellán, se añadieron dieciseis camas a las ocho que ya había, se emplearon tres mil quinientos pesos en restablecer una botica cuyos medicamentos se trajeron de la ciudad de México; se puso al frente de la misma a un boticario examinado con sueldo de cuatrocientos pesos anuales y se llevó a un médico con una renta fija. Diez años después, en 1729, el señor doctor Don Benito Crespo, Obispo de la diócesis, bendijo con solemnidad las reformas y ampliaciones materiales de dicho hospital  y el 7 de marzo de 1739 se hizo la consagración de la iglesia anexa al mismo, que en la actualidad conocemos como templo de San Juan de Dios.

Cuando se consumó la independencia de México, fue imperativo legal retirar de todos los edificios públicos el Escudo De La Real Corona Española y sustituirlo por el escudo nacional de la época, el cual tiene una leyenda al pie que dice: “SE ESTABLECIÓ ESTE HOSPITAL EL AÑO DE 1719 PARA POBRES ESTABLECIENDO SOBRE OTRO ESTAS ARMAS EL DÍA 29 DE MARZO DEL AÑO DE 1822 SEGUNDO DE NUESTRA INDEPENDENCIA”. Durante la época de México independiente hasta el año de 1918 funcionó como hospital dando atención médica y hospitalaria a personas pobres, de donde tomo el nombre de “Hospital de Los Pobres” como se le conoció por muchos años.

En el año de 1920 el edificio fue expropiado por causa de utilidad pública y parte de su terreno fue donado para la Logia Masónica y en el resto se construyó la Escuela Primaria Alberto M. Alvarado que todavía funciona en la actualidad. Los terrenos de la huerta del hospital y convento se expropiaron para construir en ellos el Centro Escolar Guadalupe Victoria.